More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0670 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
288 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  42.47 
 
 
307 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  40.69 
 
 
288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  35.42 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  31.23 
 
 
270 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  36.62 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  35.5 
 
 
479 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  34.91 
 
 
479 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  31.88 
 
 
513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.82 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.9 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  32.88 
 
 
315 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  31.42 
 
 
279 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  31.42 
 
 
279 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.9 
 
 
478 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
424 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  31.19 
 
 
282 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 
489 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  31.8 
 
 
392 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 
480 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.44 
 
 
489 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  29.39 
 
 
474 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.13 
 
 
484 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 
489 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  28.52 
 
 
340 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  30.26 
 
 
504 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  29.31 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 
492 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  32.57 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 
453 aa  99  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.99 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  29.26 
 
 
490 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.3 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  30.38 
 
 
479 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
445 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.53 
 
 
500 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.39 
 
 
475 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  32.09 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  35.42 
 
 
479 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 
427 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  27.91 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  28.96 
 
 
265 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 
494 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  28.26 
 
 
568 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
268 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  29.61 
 
 
573 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.16 
 
 
493 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.92 
 
 
489 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  29.49 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 
493 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
567 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  28.9 
 
 
365 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  29.3 
 
 
561 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  29.61 
 
 
268 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
432 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  27.83 
 
 
554 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  28.99 
 
 
569 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  28.96 
 
 
494 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.36 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 
486 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  31.47 
 
 
513 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.2 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  28.38 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  30.13 
 
 
262 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 
502 aa  90.1  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  29.13 
 
 
255 aa  89.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  27.85 
 
 
566 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  29.81 
 
 
423 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  29.77 
 
 
604 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  27.95 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.22 
 
 
442 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  26.62 
 
 
494 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  26.62 
 
 
494 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  28.28 
 
 
605 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  26.62 
 
 
524 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.64 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  23.91 
 
 
487 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  28.16 
 
 
263 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 
447 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  26.32 
 
 
488 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.33 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  26.69 
 
 
487 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  29.68 
 
 
490 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
493 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
365 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  32.79 
 
 
524 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  26.5 
 
 
480 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  25.18 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 
395 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  28 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  24.57 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  30.77 
 
 
471 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  24.64 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  30.1 
 
 
632 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  27.09 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  28.51 
 
 
589 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>