More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0568 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  100 
 
 		 518 aa  1043    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  47.98 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  47.94 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  42.51 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  45.68 
 
 		 479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  40.92 
 
 		 605 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  37.14 
 
 		 573 aa  277  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  36.31 
 
 		 484 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  37.04 
 
 		 561 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  36.63 
 
 		 569 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  39.79 
 
 		 500 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  36.21 
 
 		 567 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  38.63 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  34.32 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  36.81 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  38.62 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  38.98 
 
 		 478 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  38.98 
 
 		 478 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  37.4 
 
 		 564 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  38.09 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  38.09 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  38.09 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  36.93 
 
 		 564 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 		 478 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  34.41 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  37.2 
 
 		 564 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  33.92 
 
 		 486 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 		 562 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 		 562 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  36.97 
 
 		 477 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 		 489 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 		 489 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  36.91 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  32.11 
 
 		 565 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  36.32 
 
 		 477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  36.91 
 
 		 477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  37.28 
 
 		 477 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  35.42 
 
 		 474 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  34.1 
 
 		 590 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  34.37 
 
 		 569 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.68 
 
 		 572 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.68 
 
 		 572 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  35.68 
 
 		 572 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35.68 
 
 		 572 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  35.68 
 
 		 589 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.68 
 
 		 560 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  35.68 
 
 		 589 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  35.06 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  35.53 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  33.48 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 		 480 aa  220  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 		 486 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  34.58 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 		 490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  34.03 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  31.71 
 
 		 483 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  35.56 
 
 		 483 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  33.47 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  45.11 
 
 		 514 aa  207  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  34.83 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  33.8 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  34.45 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  45.38 
 
 		 549 aa  203  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  38.51 
 
 		 548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  36.43 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  35.08 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  37.56 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  32.3 
 
 		 478 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  33.41 
 
 		 488 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  32.07 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  32.59 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  41.7 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.25 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  41 
 
 		 554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  34.44 
 
 		 490 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  30.9 
 
 		 494 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 		 487 aa  176  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  28.87 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  44.68 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  33.42 
 
 		 521 aa  171  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  38.27 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  28.64 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  28.64 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  43.3 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  34.22 
 
 		 481 aa  163  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  35.53 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  36.84 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29.35 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>