More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0989 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
270 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  36.6 
 
 
292 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  34.83 
 
 
292 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  37.21 
 
 
312 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.78 
 
 
307 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  38.76 
 
 
315 aa  129  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  33.62 
 
 
288 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  30.29 
 
 
294 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
340 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  33.48 
 
 
424 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  30.38 
 
 
288 aa  106  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 
286 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
278 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 
524 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  31.28 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.36 
 
 
513 aa  96.3  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 
493 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  38.56 
 
 
513 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
482 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  34.45 
 
 
478 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  34.45 
 
 
500 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  34.45 
 
 
487 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.88 
 
 
436 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
513 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.09 
 
 
489 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  30.73 
 
 
285 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  40.16 
 
 
493 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
503 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  26.55 
 
 
479 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.25 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 
489 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  33.66 
 
 
494 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  27.48 
 
 
492 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0608  peptidase M48, Ste24p  28.81 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  30.84 
 
 
479 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
489 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.44 
 
 
484 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  26.03 
 
 
490 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  29.82 
 
 
427 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 
569 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  31.31 
 
 
489 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 
520 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  31.18 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  30.24 
 
 
516 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  30.05 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  29.28 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  26.14 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  27.31 
 
 
488 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  26.98 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  32.1 
 
 
480 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
567 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  27.14 
 
 
550 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.16 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  31.4 
 
 
493 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  31.4 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  26.09 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 
514 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  29.9 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 
505 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.64 
 
 
561 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 
480 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  29.61 
 
 
471 aa  79  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  27.31 
 
 
262 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 
365 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  26.55 
 
 
496 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  27.59 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  29.22 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  26.29 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  31.4 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  31.94 
 
 
494 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  25.57 
 
 
497 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 
480 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 
502 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  28.37 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 
479 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 
604 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  25.22 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  26.6 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  24.53 
 
 
632 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  24.53 
 
 
632 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  26.64 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  26.64 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.08 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  26.88 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  26.64 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  25.65 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  25.91 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>