More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1761 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  91.6 
 
 
476 aa  899    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  100 
 
 
493 aa  1005    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  99.16 
 
 
475 aa  957    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  60.64 
 
 
480 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  61.92 
 
 
503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  61.64 
 
 
482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  60.86 
 
 
513 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  59.58 
 
 
513 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  54.77 
 
 
471 aa  504  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  43.06 
 
 
488 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  43.55 
 
 
496 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  44.44 
 
 
505 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  44.58 
 
 
497 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  45.6 
 
 
503 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  45.39 
 
 
497 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  45.83 
 
 
497 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  40.4 
 
 
520 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  44.5 
 
 
516 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  42 
 
 
478 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  39.84 
 
 
504 aa  353  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  41.3 
 
 
500 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  41.3 
 
 
487 aa  351  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  41.53 
 
 
493 aa  349  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  41.91 
 
 
514 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  41.3 
 
 
524 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  40.14 
 
 
494 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.46 
 
 
493 aa  239  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.58 
 
 
513 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.33 
 
 
479 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  31.17 
 
 
479 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.77 
 
 
479 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.42 
 
 
513 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 
478 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.36 
 
 
490 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 
489 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  29.24 
 
 
489 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.6 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  28.72 
 
 
489 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  25.97 
 
 
479 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  26.81 
 
 
493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  27.93 
 
 
494 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  35.63 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.2 
 
 
264 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.75 
 
 
278 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.45 
 
 
268 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.47 
 
 
436 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
268 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.03 
 
 
282 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 
289 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  34.54 
 
 
269 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 
289 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.5 
 
 
286 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
269 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 
268 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  30.58 
 
 
288 aa  98.6  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  30.36 
 
 
423 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  32.32 
 
 
255 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
269 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
269 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  32.72 
 
 
554 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
269 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.33 
 
 
280 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.11 
 
 
278 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 
266 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  32.72 
 
 
568 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 
284 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 
266 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  34.22 
 
 
285 aa  94  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  31.77 
 
 
269 aa  93.6  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  31.79 
 
 
266 aa  93.6  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  33 
 
 
484 aa  93.6  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  30.41 
 
 
272 aa  93.6  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 
427 aa  93.2  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 
293 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.55 
 
 
262 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 
432 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
443 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 
529 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  31.52 
 
 
279 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  31.52 
 
 
279 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  34.03 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 
445 aa  91.3  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 
315 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  33.01 
 
 
307 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.17 
 
 
294 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  34.76 
 
 
289 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 
269 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 
269 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 
269 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  30.27 
 
 
268 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  29.39 
 
 
288 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  28.75 
 
 
275 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  34.22 
 
 
289 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  32.13 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  32.16 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  28.87 
 
 
262 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  31.92 
 
 
566 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>