More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2547 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  80.56 
 
 
252 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  68 
 
 
250 aa  359  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  64.8 
 
 
250 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  64.8 
 
 
250 aa  344  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  64.4 
 
 
250 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  63.45 
 
 
252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  63.05 
 
 
252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  62.25 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  62.25 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  62.25 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  62.25 
 
 
252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  62.25 
 
 
252 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  62.25 
 
 
252 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  61.85 
 
 
252 aa  317  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  61.45 
 
 
252 aa  315  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  62 
 
 
250 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  60.96 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  65.93 
 
 
249 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  66.12 
 
 
253 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  56.15 
 
 
253 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  56.15 
 
 
253 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  56.15 
 
 
253 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  56.15 
 
 
253 aa  291  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  63.2 
 
 
253 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  55.74 
 
 
253 aa  290  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  59.92 
 
 
250 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  63.2 
 
 
253 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  66.12 
 
 
253 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  66.12 
 
 
253 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  65.65 
 
 
250 aa  289  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  66.12 
 
 
604 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  62.4 
 
 
250 aa  285  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  58.26 
 
 
252 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  58.7 
 
 
252 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  53.54 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  53.54 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  53.54 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  53.54 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  53.54 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  64.9 
 
 
253 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  53.15 
 
 
262 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  53.15 
 
 
254 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  56.77 
 
 
254 aa  278  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  56.77 
 
 
235 aa  278  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  57.2 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  56.97 
 
 
254 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  59.38 
 
 
261 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  42.51 
 
 
256 aa  192  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  45.16 
 
 
312 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  45.75 
 
 
275 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  40.16 
 
 
269 aa  178  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  38.98 
 
 
290 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  37.04 
 
 
289 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 
271 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  27.96 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.72 
 
 
268 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.01 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  36.6 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.64 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  29.52 
 
 
424 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  27.2 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  28.46 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.91 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  28.63 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  26.42 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.52 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  29.25 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  30.82 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  29.25 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
319 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  25.58 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  29.21 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.49 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  32.31 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  26.52 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.28 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  29.33 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  31.79 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  33.95 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  27.2 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  27.53 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  30.14 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>