More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0242 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  100 
 
 
319 aa  645    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0965  peptidase M48 Ste24p  56.04 
 
 
325 aa  343  2e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0519  heat shock protein HtpX  57.63 
 
 
334 aa  331  9e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287918  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2626  peptidase M48 Ste24p  38.91 
 
 
311 aa  204  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1012  peptidase M48, Ste24p  41.54 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00402297 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  34.22 
 
 
348 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1218  peptidase M48, Ste24p  32.38 
 
 
372 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416464  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  36.07 
 
 
337 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1192  HtpX-2 peptidase  33.79 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0841  peptidase M48 Ste24p  33.22 
 
 
351 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.843942  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0989  peptidase M48, Ste24p  34.25 
 
 
347 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.230261 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 
397 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  30.91 
 
 
397 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  31.01 
 
 
396 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  31.13 
 
 
279 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  29.49 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  34.63 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  28.16 
 
 
342 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  31.32 
 
 
287 aa  94  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  28.75 
 
 
320 aa  94  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  27.45 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  28.42 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 
286 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  28.43 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0795  peptidase M48 Ste24p  29.17 
 
 
274 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  28.81 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  28.43 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  30.24 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  35.2 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0833  peptidase M48 Ste24p  28.1 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  28.8 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  35.09 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
287 aa  89.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  28.47 
 
 
268 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  27.24 
 
 
282 aa  89  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  30.94 
 
 
289 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  26.14 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  30.83 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  30.88 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  27.16 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  28.78 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  28.29 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1813  HtpX domain protein  30.28 
 
 
293 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1920  heat shock protein HtpX  29.48 
 
 
293 aa  87  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2058  heat shock protein HtpX  29.48 
 
 
293 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1358  heat shock protein HtpX  29.48 
 
 
293 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00135277  normal  0.0441345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2561  heat shock protein HtpX  29.48 
 
 
293 aa  87  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000337122  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2097  heat shock protein HtpX  29.48 
 
 
293 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000180088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1803  heat shock protein HtpX  29.48 
 
 
293 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  normal  0.04369 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  27.84 
 
 
284 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01800  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
293 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01788  hypothetical protein  29.08 
 
 
293 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
316 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  26.05 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  30.58 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  27.42 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  26.14 
 
 
320 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  27.04 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  27.89 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0373  peptidase M48 Ste24p  29.15 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0941774  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  28.3 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  27.31 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1517  heat shock protein HtpX  28.97 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0660  heat shock protein HtpX  28.97 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  27.76 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1008  heat shock protein HtpX  30.83 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1471  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  0.222056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1287  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000384328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1987  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2045  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1983  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  0.0234339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  26.24 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  32.61 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  32.61 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  30.77 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  26.79 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1145  peptidase M48, Ste24p  24.19 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000113626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  28.09 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  26.4 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  32.9 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  27.27 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  31.2 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  25.8 
 
 
285 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  27.4 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  27.85 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  29.61 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  27.96 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  25.99 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>