More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1012 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1012  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
310 aa  614  1e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00402297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2626  peptidase M48 Ste24p  69.61 
 
 
311 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0242  heat shock protein HtpX  41.54 
 
 
319 aa  210  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.61908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0965  peptidase M48 Ste24p  35.87 
 
 
325 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0519  heat shock protein HtpX  36.67 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287918  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  32.83 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1192  HtpX-2 peptidase  29.75 
 
 
344 aa  102  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0989  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 
347 aa  99  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.230261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0841  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
351 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.843942  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1218  peptidase M48, Ste24p  29.54 
 
 
372 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  30 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0795  peptidase M48 Ste24p  27.18 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  27.9 
 
 
279 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  37.22 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  35.29 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  29.46 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  27.06 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  27.15 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  30.08 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  29.76 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  28.05 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  28.05 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  28.05 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  29.29 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  29.29 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  29.96 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  32.78 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  28 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  29.79 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  29.39 
 
 
285 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  30.74 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  30.21 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  30.21 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  30.21 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  31.03 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  29.8 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  28.87 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  26.76 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  28.71 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  32.64 
 
 
289 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  28.37 
 
 
313 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3512  heat shock protein HtpX  31.27 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465022  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  29.79 
 
 
285 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  29.22 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  26.48 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  30.22 
 
 
286 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  27.54 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  30.07 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  27.63 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  26.51 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  28 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  30.67 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  26.97 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  30.17 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  30.04 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  30.47 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  27.27 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  29.08 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  29.45 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  27.46 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  30.83 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  27.3 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  30.25 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  27.62 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  31.25 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  28.69 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  28.4 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  29.24 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2662  heat shock protein HtpX  27.71 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000479868  hitchhiker  0.00874622 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  27.5 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1674  heat shock protein HtpX  27.71 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00952626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1784  heat shock protein HtpX  27.71 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000381435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0952  heat shock protein HtpX  29.25 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0584228  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  31.47 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  27.87 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6075  heat shock protein HtpX  27.54 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0954  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  31.6 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.06 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  26.29 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1860  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  26.86 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  30.96 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  28.57 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>