78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3608 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
310 aa  564  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  45.87 
 
 
330 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  45.78 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  49.19 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  43.85 
 
 
315 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  42.81 
 
 
314 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  38.02 
 
 
407 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  38.13 
 
 
301 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  42.37 
 
 
308 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  40.06 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  41.7 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 
301 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  40.75 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  39.8 
 
 
315 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  37.74 
 
 
431 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  43.18 
 
 
301 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  39.36 
 
 
316 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  35.95 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  38.08 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  38.49 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  38.49 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  38.49 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  37.46 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 
313 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  32.69 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  36.5 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  40.15 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  40.15 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  40.15 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  35.63 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  36.09 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  35.87 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  39.16 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  36.93 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  36.93 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  39.62 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  30.09 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  39.62 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  39.16 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  39.16 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  39.16 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  38.18 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  36.07 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  38.71 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  33.92 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  37.08 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  28.76 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  30.36 
 
 
660 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 
291 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  36.21 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  36.71 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  40.68 
 
 
383 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  42.31 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
358 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  23.41 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  23.41 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  23.41 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  23.41 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  48.08 
 
 
268 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  23.41 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  27.13 
 
 
260 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  29.47 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  25.93 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0183  hypothetical protein  35.56 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  55.81 
 
 
267 aa  43.5  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  31.84 
 
 
328 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0885  peptidase M48 Ste24p  30.85 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  37.93 
 
 
364 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  27.54 
 
 
700 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  26.02 
 
 
581 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>