42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0183 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0183  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  46.9 
 
 
284 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  46.9 
 
 
284 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  46.81 
 
 
282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  46.62 
 
 
279 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  43.66 
 
 
281 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  49.31 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  23.94 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  24.68 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  25.58 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  25.58 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  26.36 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  26.36 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  32.08 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  31.73 
 
 
330 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  31.43 
 
 
315 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  27.75 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  28.66 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  33.96 
 
 
314 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  27.97 
 
 
304 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  36.19 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  27.4 
 
 
330 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  27.03 
 
 
308 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  34.34 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  26.71 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  23.72 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 
431 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  28.89 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  27.4 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  30.22 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  30.7 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  24.27 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  24.28 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
317 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2952  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 
394 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>