84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2917 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  100 
 
 		 314 aa  607  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  64.13 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  54.78 
 
 		 301 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  49.5 
 
 		 308 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  49.63 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  43.42 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  45.45 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  44.74 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  44.8 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  35.85 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  39.24 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  39.39 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  45.75 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  37.37 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  40.62 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  37.5 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  39.19 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  37.13 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  36.63 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  36.49 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  33.48 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  43.48 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  36.42 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  37.65 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  32.03 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  41.09 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  33.85 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  41.32 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  41.32 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  36.57 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  33.17 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  33.67 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  33.7 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  39.34 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  39.34 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  39.34 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  38.74 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  40.98 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  27.07 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1947  peptidase M48 Ste24p  39.58 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  27.61 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  36.46 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  25 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  24.72 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0183  hypothetical protein  34.04 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  26.52 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  27.74 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  27.74 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  33.75 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  26.67 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  25.93 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  48.15 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  42.37 
 
 		 383 aa  46.2  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2952  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  41.94 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  25.93 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0885  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  35.71 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  23.14 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  32.1 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  38.71 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  24.24 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2772  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3768  hypothetical protein  27.78 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>