53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  100 
 
 
329 aa  620  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  38.82 
 
 
311 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  38.67 
 
 
316 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  38.67 
 
 
316 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  38.67 
 
 
316 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  35.8 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  38.2 
 
 
314 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  40.61 
 
 
316 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  42.68 
 
 
311 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  35.03 
 
 
313 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  35.68 
 
 
313 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  45.04 
 
 
431 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  45.53 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  33.63 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  41.09 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  31.13 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  42.28 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  37.88 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  38.36 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  32.75 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  39.24 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  39.2 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  37.6 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  31.63 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  37.14 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  32.53 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  39.34 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  36.64 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  36.97 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  36.13 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  35.43 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  34.45 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  34.45 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  34.45 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  33.77 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  34.35 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  36.56 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  36.56 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  37.1 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  31.09 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  31.09 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  31.09 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  40.66 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 
296 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  33.59 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>