61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7011 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
319 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  37.99 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  37.04 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  45.21 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  42.98 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0968  peptidase M48 Ste24p  38.77 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  39.29 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  39.29 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  39.29 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  41.07 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  40.12 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  34.38 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  38.22 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  35.53 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  39.45 
 
 
311 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  34.75 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  34.72 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  32.05 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  41.53 
 
 
431 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  39.66 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  38.1 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  33.53 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  32.86 
 
 
334 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  34.69 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  41.18 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  41.18 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  34.96 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  32.22 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  42.39 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  38.97 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  31.62 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  31.79 
 
 
314 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  35.33 
 
 
334 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  31.79 
 
 
314 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  35.59 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0168  peptidase M48 Ste24p  39.81 
 
 
329 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0842957  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  33.64 
 
 
316 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  42.31 
 
 
310 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 
291 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  37.25 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  32.38 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  32.78 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  29.06 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  33.58 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  38.71 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  38.71 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  47.37 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  26.47 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  38.54 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  29.44 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  39.62 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  34.18 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1962  heat shock protein HtpX  32.74 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.409583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 
382 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>