58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1968 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
382 aa  738    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  46.63 
 
 
338 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  37.18 
 
 
316 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  39.51 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
306 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  38.55 
 
 
306 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  38.55 
 
 
306 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  38.55 
 
 
306 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  40.54 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  34.02 
 
 
307 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  34.02 
 
 
307 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 
307 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  36.49 
 
 
314 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  38.2 
 
 
314 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  29.19 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  39.01 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  37.89 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  48.42 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  39.01 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  39.01 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  37.93 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  39.16 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  31.19 
 
 
311 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  45.28 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  38.03 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  30.62 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  40.34 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  36.89 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  37.16 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  37.16 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  37.16 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  36.99 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
313 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  34.15 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  37.95 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  39.37 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  36.2 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  36.11 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  38.58 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  36.2 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  32.8 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  37.14 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  35.43 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  34.48 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  38.1 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  33.94 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  29.1 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  38.6 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 
296 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  38.2 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  43.4 
 
 
308 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  36.84 
 
 
324 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  31.87 
 
 
660 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2952  peptidase M48 Ste24p  39.39 
 
 
394 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  32.82 
 
 
319 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>