71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1349 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
319 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  35.64 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  35.42 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  35.31 
 
 
314 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  35.11 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  34.26 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  34.26 
 
 
307 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  33.44 
 
 
314 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  34.44 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  46.46 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  46.46 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  32.56 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  32.56 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  44.83 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  34.94 
 
 
316 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  34.18 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  41.98 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  34.18 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  34.18 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  40.82 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  42.18 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  42.18 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  42.18 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  32.73 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  34.31 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  43.41 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  40.97 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  44 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  38.41 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  38.1 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  36.9 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  34.04 
 
 
338 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  41.54 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  41.73 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  46.36 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  41.26 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  41.18 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  37.87 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  42.72 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  39.52 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  40.61 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  34.27 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  40.35 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  31.78 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  38.32 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  37.38 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  42.98 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  39.62 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  32.79 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  39.1 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  37.08 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  25.77 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  25.77 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  30.3 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  21.82 
 
 
270 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  42.31 
 
 
383 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  21.37 
 
 
270 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  21.37 
 
 
270 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  39.62 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  21.37 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  21.37 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  21.37 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0499  hypothetical protein  30.25 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  36.78 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  37.88 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  35.58 
 
 
330 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  35.58 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  20.51 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>