60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5555 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 
308 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  42.29 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  41.33 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  41.38 
 
 
307 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  41.38 
 
 
307 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  43.35 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 
314 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  42.49 
 
 
306 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  42.59 
 
 
314 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  42.59 
 
 
314 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  42.53 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  42.24 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  42.24 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  41.44 
 
 
314 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  37.2 
 
 
316 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  44.35 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  37.93 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  38.4 
 
 
334 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  33.17 
 
 
314 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  32.49 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  30.26 
 
 
338 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  40.88 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  40.88 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  40.88 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  41.28 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  40.74 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  35.02 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  37.79 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  43.08 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  43.65 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  34.48 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  33.92 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  39.1 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  35.45 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  38.82 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  35.91 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  36.81 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  33.9 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  39.13 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  38.13 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  43.88 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 
431 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  33.85 
 
 
334 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  40.95 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0885  peptidase M48 Ste24p  32.69 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  39.57 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1947  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1286  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1976  peptidase M48, Ste24p  26.21 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  38.3 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  30.38 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  28.24 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>