54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5640 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
338 aa  656    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  46.79 
 
 
382 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  36.93 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  35.4 
 
 
314 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 
306 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  31.83 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  31.8 
 
 
306 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  31.8 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  31.8 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 
330 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  27.95 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  30.67 
 
 
407 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  34.81 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  36.41 
 
 
301 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  33.09 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  30.48 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  31.37 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  32.17 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  41.54 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  32.06 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  32.71 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  32.43 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  42.73 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  36.69 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  31.2 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  28.81 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  38.52 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  38.74 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  31.25 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  29.32 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  31.42 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
296 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  33.59 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  30.18 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2952  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1947  peptidase M48 Ste24p  35.06 
 
 
370 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>