57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2232 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 308 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  37.67 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  41.13 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  43.28 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0968  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  37.68 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  37.68 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  37.68 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  37.11 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  42.19 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  36.97 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  42.15 
 
 		 431 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  40.98 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  39.68 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  40.46 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  36.94 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 		 382 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  43.48 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  36.62 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  38.02 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  42.31 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  39.64 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  36.22 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  33.88 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  38.19 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  38.14 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  36.21 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  31.36 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  37.74 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  34.48 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  35.06 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  39.39 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  31.25 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  35.25 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  34.23 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  34.23 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  34.23 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  40.62 
 
 		 428 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  36.92 
 
 		 675 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  36.36 
 
 		 421 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0890  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 		 396 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  33.55 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0710796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>