More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1482 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  100 
 
 		 421 aa  835    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  77 
 
 		 437 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  76.75 
 
 		 437 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  76.36 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  71.87 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  76.43 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  70.89 
 
 		 675 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  71.78 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  62.68 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  71.06 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  59.71 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  59.71 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  59.71 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  59.22 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  59.47 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  71.77 
 
 		 422 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  58.31 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  60.58 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  58.21 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  58.8 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  58.31 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  61.89 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  61.89 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  61.89 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  59.22 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  62.14 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  61.59 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  61.59 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  61.59 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  61.59 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  59.47 
 
 		 419 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  59.52 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  55.07 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  58.31 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  56.49 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  56.87 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  56.83 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  52.3 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  51.68 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  51.69 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  53.63 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  49.52 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  51.55 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  40.78 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  40.9 
 
 		 410 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  43.21 
 
 		 414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  41.16 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  39.31 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  37.35 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  40.24 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  39.76 
 
 		 416 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  33.83 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  39.51 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  36.08 
 
 		 420 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  38.48 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  39.17 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  34.16 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  35.82 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  42.13 
 
 		 422 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  36.87 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  36.93 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  34.09 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  36.9 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  36.48 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 395 aa  232  9e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  33.59 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  32.53 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  34.37 
 
 		 452 aa  229  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  35.7 
 
 		 415 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  37.66 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  37.05 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  34.56 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  35.92 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  35.03 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  36.09 
 
 		 460 aa  216  8e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  42.11 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  32.65 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  36.79 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  29.59 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  28.67 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  36.13 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  31.6 
 
 		 418 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  39.46 
 
 		 410 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  36.05 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  35.86 
 
 		 415 aa  179  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  32.11 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63669  predicted protein  29.41 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000327085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  34.38 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33410  predicted protein  32.11 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.841869  normal  0.225834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  31.22 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  30.77 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  32.8 
 
 		 407 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  31.79 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  30.46 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  30.79 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1280  peptidase, M48 family  28.43 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.870615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1045  M48 family peptidase  28.43 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>