50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5279 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 383 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  48.21 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  48.98 
 
 		 308 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  38.85 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  34.03 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  34.23 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  39.39 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  36.08 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  38.38 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  38.38 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  51.92 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  40.62 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  38.35 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  37.58 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  38.54 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  39.58 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  38.54 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  38.54 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0968  peptidase M48 Ste24p  42.55 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  35.46 
 
 		 296 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  37.11 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  34.21 
 
 		 334 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  32.09 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  35.11 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  40.43 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  46.94 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  50.94 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  46.94 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  35.64 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  42.11 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  27.4 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  22.62 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  34.68 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  45.28 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  28.74 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  29.33 
 
 		 297 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 		 268 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  39.39 
 
 		 255 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>