41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9019 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
331 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  35.02 
 
 
308 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  36.73 
 
 
319 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0968  peptidase M48 Ste24p  38.51 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  31.14 
 
 
307 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  33.76 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  33.76 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  33.76 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
316 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  35.04 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 
316 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 
316 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  29.73 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 
316 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  30.77 
 
 
472 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  33.75 
 
 
314 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  35.48 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  28.87 
 
 
631 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.98 
 
 
619 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  33.77 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  34.31 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  35.34 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  32.77 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  34.59 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  40.48 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  32.26 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  32.26 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  34.59 
 
 
330 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.7 
 
 
589 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  33.59 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  36.51 
 
 
310 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  33.62 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  24.82 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  35.29 
 
 
316 aa  42.7  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  31.47 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>