63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4387 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4387  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 326 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  79.75 
 
 		 326 aa  541  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  46.18 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  31.71 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1350  peptidase M56, BlaR1  25.4 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.205977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  28.31 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  23.81 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3493  peptidase M56 BlaR1  22.37 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2623  peptidase M56 BlaR1  22.37 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0123908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  33.75 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  33.75 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  28.68 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  24.68 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  29.53 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  23.13 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  23.13 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  27.56 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  23.13 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  23.13 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  23.13 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  26.05 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  23.13 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  23.13 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1386  heat shock protein HtpX  33.75 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.759716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  22.97 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  34.09 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  27.21 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  32.43 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  34.85 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0379  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000263492  hitchhiker  0.0000000000000384253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  27.5 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  25.96 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  41.38 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  25.96 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  26.73 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  33.75 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3358  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000541499  hitchhiker  0.000159799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.75 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  41.38 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  27.4 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  37.31 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  23.79 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  27.05 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2482  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  29.63 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  26.37 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  26.72 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  41.38 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  32.5 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  37.31 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31050  hypothetical protein  28.49 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019921  unclonable  2.92536e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  25.96 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  27.16 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  32.5 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  32.05 
 
 		 285 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0242  heat shock protein  38.81 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  26.72 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  28.18 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>