194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4396 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
364 aa  731    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  53.74 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  54.06 
 
 
346 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  54.46 
 
 
364 aa  338  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  51.41 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  53.61 
 
 
348 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  51.9 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  52.53 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  50.6 
 
 
341 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  49.85 
 
 
351 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  50.15 
 
 
383 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  50.31 
 
 
358 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  49.52 
 
 
344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  48.45 
 
 
348 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  41.81 
 
 
318 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  37.13 
 
 
324 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  36.9 
 
 
291 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  35.76 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 
291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  35.76 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  32.29 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 
291 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0168  peptidase M48 Ste24p  36.95 
 
 
329 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0842957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 
291 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  34.8 
 
 
291 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 
432 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2224  peptidase M48 Ste24p  35.99 
 
 
303 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  0.0711266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 
447 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 
447 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  29.61 
 
 
441 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1579  M48 family peptidase  37.31 
 
 
289 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.988956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  25.91 
 
 
447 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0423  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 
298 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.666925  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0247  heat shock protein HtpX  30.2 
 
 
298 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 
447 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
405 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 
447 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 
447 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  27.23 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  27.61 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  27.12 
 
 
444 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  27.23 
 
 
444 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  34.71 
 
 
424 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  28.64 
 
 
287 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  33.33 
 
 
281 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 
440 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  28.83 
 
 
283 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  26.51 
 
 
291 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 
444 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  23.72 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  26.01 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0401  M48 family peptidase  30.77 
 
 
282 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000207602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  26.09 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1114  heat shock protein HtpX  36.76 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.673422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5219  peptidase M48 Ste24p  30.14 
 
 
676 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0606232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2952  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  28.3 
 
 
251 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  27.44 
 
 
289 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  31.53 
 
 
324 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
427 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 
308 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  26.92 
 
 
320 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  26.24 
 
 
267 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  33.33 
 
 
318 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  30.77 
 
 
265 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  42.03 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2034  peptidase M48 Ste24p  30.69 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2673  HtpX-2 peptidase  37.1 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121474  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  35.9 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  25.25 
 
 
292 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  32.53 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  27.63 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.49 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  22.18 
 
 
285 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  29.67 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  31.94 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  22.18 
 
 
285 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  25.76 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  29.79 
 
 
564 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 
593 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  22.58 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  34.75 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 
588 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  22.22 
 
 
285 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  26.22 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  42.03 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  22.1 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 
564 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  22.1 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3243  peptidase M48, Ste24p  32.56 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000873344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>