128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5870 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
344 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  61.14 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  50.77 
 
 
364 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  49.22 
 
 
351 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  49.69 
 
 
346 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  48.3 
 
 
352 aa  319  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  49.37 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  46.34 
 
 
344 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  49.52 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  50.78 
 
 
383 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  45.87 
 
 
341 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  46.34 
 
 
336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  48.54 
 
 
330 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  45.03 
 
 
358 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  35.61 
 
 
320 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  31.75 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 
320 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 
320 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  33.21 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  33.96 
 
 
291 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  33.81 
 
 
291 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  33.81 
 
 
291 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0168  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 
329 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0842957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  33.69 
 
 
291 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  34.41 
 
 
324 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  36.96 
 
 
318 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  32.73 
 
 
291 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2224  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  0.0711266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 
432 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  30.49 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 
447 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1114  heat shock protein HtpX  43.9 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.673422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  26.32 
 
 
447 aa  59.7  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
447 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  26.26 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
447 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  25.14 
 
 
447 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  25.14 
 
 
447 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  26.19 
 
 
441 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
256 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  27.65 
 
 
290 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  42.11 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  34.41 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 
444 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 
444 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  34.41 
 
 
396 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  27.62 
 
 
441 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  24.58 
 
 
440 aa  52.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  38.37 
 
 
307 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6655  peptidase M48 Ste24p  40.79 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  36.78 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  25 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  34.88 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  38.55 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  34.12 
 
 
283 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  35.63 
 
 
316 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  36.14 
 
 
324 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  30.85 
 
 
267 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  40 
 
 
307 aa  49.3  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0423  peptidase M48 Ste24p  36.76 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.666925  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0247  heat shock protein HtpX  36.76 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  32.04 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2259  heat shock protein HtpX  30 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  32.35 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  27.55 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  25.98 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  35.37 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  26.09 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  32.56 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  24.7 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  32.56 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  25 
 
 
299 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  22.02 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  32.56 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  39.68 
 
 
282 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  34.67 
 
 
304 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4537  peptidase M48 Ste24p  34.88 
 
 
274 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2658  peptidase M48, Ste24p  28.41 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
285 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1995  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  47.17 
 
 
319 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1774  HtpX domain-containing protein  28.57 
 
 
293 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  34.34 
 
 
287 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  29.67 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  31.31 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  31.71 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0734  peptidase M48 Ste24p  26.71 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  31.71 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  31.71 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0660  heat shock protein HtpX  31.4 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  23.35 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1529  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1110  peptidase M48 Ste24p  31.63 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>