73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12008 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  708    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  63.08 
 
 
352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  56.16 
 
 
364 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  53.39 
 
 
341 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  49.42 
 
 
358 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  53.61 
 
 
364 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  48.99 
 
 
346 aa  329  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  49.7 
 
 
336 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  47.6 
 
 
351 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  48.54 
 
 
344 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  49.37 
 
 
344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  49.26 
 
 
383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  50.8 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  47.02 
 
 
348 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 
320 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  34.77 
 
 
320 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  37.41 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 
319 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
320 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
320 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0168  peptidase M48 Ste24p  33.44 
 
 
329 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0842957  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 
291 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  35.21 
 
 
291 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  34.98 
 
 
432 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  35.85 
 
 
291 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  37.13 
 
 
291 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  36.23 
 
 
324 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2224  peptidase M48 Ste24p  35.15 
 
 
303 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  0.0711266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  34.31 
 
 
291 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  27.23 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  31.05 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
447 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  30.06 
 
 
441 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  24.88 
 
 
447 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  24.88 
 
 
447 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  25.42 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  28.17 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  24.84 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  27.38 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  24.88 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  32.14 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  25.81 
 
 
292 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  24.88 
 
 
447 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  24.43 
 
 
444 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.88 
 
 
589 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.88 
 
 
560 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  24.29 
 
 
440 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.88 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.88 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.88 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.88 
 
 
572 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.88 
 
 
589 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  30.95 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  30.95 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0423  peptidase M48 Ste24p  32.84 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.666925  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40690  predicted protein  30.83 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  30.95 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0247  heat shock protein HtpX  32.84 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  24.45 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2900  peptidase M48, Ste24p  37.1 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2118  heat shock protein HtpX  31.25 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  23.14 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0535  HtpX domain protein  31.25 
 
 
295 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0793036  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  28.57 
 
 
262 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1916  heat shock protein HtpX  33.77 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  27.97 
 
 
284 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
505 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
295 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>