51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0113 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  77.95 
 
 		 447 aa  700    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  99.1 
 
 		 444 aa  915    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  98.65 
 
 		 444 aa  913    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  84.04 
 
 		 440 aa  757    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  99.1 
 
 		 444 aa  914    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  78.62 
 
 		 447 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  78.17 
 
 		 447 aa  724    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 444 aa  922    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  78.62 
 
 		 447 aa  708    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  34.38 
 
 		 405 aa  206  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  33.56 
 
 		 447 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  33.55 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  33.22 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  30.41 
 
 		 267 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  31.03 
 
 		 265 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 		 441 aa  97.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 		 287 aa  97.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 		 256 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  27.86 
 
 		 441 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  29.52 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  28.31 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  29.59 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  28.71 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  28.32 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  27.17 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  24.86 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  26.64 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  26.59 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  26.29 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  28.72 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  25.55 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  25.43 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  25.65 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  24.71 
 
 		 291 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  24.71 
 
 		 291 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  23 
 
 		 320 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  23 
 
 		 320 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  27.17 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2636  peptidase M48, Ste24p  33.87 
 
 		 72 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000427848  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1286  peptidase M48 Ste24p  26.02 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  24.43 
 
 		 348 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  27.33 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  30.07 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  27.56 
 
 		 147 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  26.03 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  25.43 
 
 		 352 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>