175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2481 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 
256 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  34.34 
 
 
265 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 
441 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  32.16 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  29.33 
 
 
441 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
447 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  37.11 
 
 
447 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  37.11 
 
 
447 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  29.39 
 
 
447 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  29.39 
 
 
447 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  29.39 
 
 
447 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  30.23 
 
 
447 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
440 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
444 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 
405 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
444 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
444 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
444 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  25.34 
 
 
288 aa  62  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  25.86 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  26.04 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  27.88 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  27.85 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  27.85 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  27.85 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  27.85 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  27.85 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  27.73 
 
 
285 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  27.73 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  27.43 
 
 
285 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  27.39 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  27.5 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  26.81 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3202  HtpX-2 peptidase  21.62 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  26.37 
 
 
313 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  24.89 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  25.42 
 
 
279 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  23.66 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  27.07 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  23.28 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  27.39 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  24.56 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  27.43 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  26.24 
 
 
346 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  25.86 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  26.84 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  25.95 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  25.64 
 
 
316 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  24.45 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  23.44 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0648  HtpX-2 peptidase  24.08 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  23.45 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  23.45 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  24.43 
 
 
351 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  24.47 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  25.11 
 
 
289 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  25.18 
 
 
291 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  26.64 
 
 
286 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  27.93 
 
 
383 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  23.24 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  26.54 
 
 
297 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  25.9 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  24.17 
 
 
432 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  22.79 
 
 
341 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  26.27 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  26.41 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  28.93 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2035  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.944318  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  22.98 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1342  M48 family peptidase  27.35 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000392563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  24.24 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  23.24 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2636  peptidase M48, Ste24p  42.31 
 
 
72 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000427848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  26.6 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  25.66 
 
 
336 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  30.85 
 
 
344 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0528  heat shock protein HtpX  25.11 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  23.16 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0206  peptidase M48 Ste24p  28.19 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  27.59 
 
 
292 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  24.34 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2018  HtpX-2 peptidase  26.5 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  25.11 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0345  HtpX-2 peptidase  22.99 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.937854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1211  peptidase M48 Ste24p  24.79 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  25.11 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  26.17 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1945  peptidase M48 Ste24p  25.21 
 
 
299 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>