51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0107 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  82.77 
 
 
447 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  83.11 
 
 
444 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  83.78 
 
 
444 aa  751    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
440 aa  915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  83.11 
 
 
444 aa  773    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  83.33 
 
 
444 aa  774    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  81.88 
 
 
447 aa  725    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  82.1 
 
 
447 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  83.45 
 
 
447 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  34.44 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  35.47 
 
 
447 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  34.8 
 
 
447 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  34.46 
 
 
447 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  29.7 
 
 
267 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 
287 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  27.04 
 
 
441 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  29.56 
 
 
265 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  29.13 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  25.13 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  28.19 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  27.78 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  29.94 
 
 
432 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  28.07 
 
 
324 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  28.32 
 
 
291 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  24.54 
 
 
348 aa  60.1  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  26.01 
 
 
291 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  25.93 
 
 
330 aa  56.6  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  25.23 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  24.58 
 
 
344 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  23.08 
 
 
320 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  24.28 
 
 
341 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  23.08 
 
 
320 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  24.45 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  23.12 
 
 
291 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  27.14 
 
 
358 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  27.74 
 
 
364 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  23.84 
 
 
147 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  22.86 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2636  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 
72 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000427848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  22.86 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  27.85 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  27.48 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  24.29 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  26.37 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1286  peptidase M48 Ste24p  26.47 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  25.43 
 
 
352 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  24.48 
 
 
290 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>