51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0110 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  78.62 
 
 		 444 aa  713    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  78.84 
 
 		 444 aa  716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  83.45 
 
 		 440 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  100 
 
 		 447 aa  929    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  78.4 
 
 		 444 aa  740    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  78.17 
 
 		 444 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  91.72 
 
 		 447 aa  822    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  90.6 
 
 		 447 aa  814    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  91.05 
 
 		 447 aa  837    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  32.83 
 
 		 405 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  37.46 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  35.81 
 
 		 447 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  35.47 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  30.23 
 
 		 267 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 441 aa  100  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  26.59 
 
 		 287 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  29.25 
 
 		 265 aa  93.6  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  24.9 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  27.67 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  27.08 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  25.2 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  28.02 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  27.78 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  25.46 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  27.62 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  28.18 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  26.56 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  27.96 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  26.32 
 
 		 344 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  23.74 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  23.74 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  25.97 
 
 		 291 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  24.88 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  24.23 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  25.91 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  22.58 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  24.6 
 
 		 364 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2636  peptidase M48, Ste24p  38.78 
 
 		 72 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000427848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  24.86 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  26.44 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  28.3 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  24.88 
 
 		 348 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  27.23 
 
 		 318 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  22.53 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  22.53 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  23.9 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  25.96 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  26.09 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  25.2 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  24.11 
 
 		 290 aa  43.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>