247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2172 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  78.36 
 
 
351 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  65.38 
 
 
341 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  63.1 
 
 
344 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  65.17 
 
 
336 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  55.04 
 
 
352 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  51.76 
 
 
358 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  50.58 
 
 
364 aa  349  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  54.06 
 
 
364 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  54.32 
 
 
383 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  50.8 
 
 
330 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  48.99 
 
 
348 aa  329  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  49.69 
 
 
344 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  50.47 
 
 
348 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0168  peptidase M48 Ste24p  41.88 
 
 
329 aa  185  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0842957  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  38.2 
 
 
291 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  37.96 
 
 
291 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  37.89 
 
 
291 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  37.96 
 
 
291 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  37.73 
 
 
324 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  38.75 
 
 
291 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  38.66 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  34.71 
 
 
320 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
320 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
320 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2224  peptidase M48 Ste24p  37.85 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  0.0711266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
432 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  33.45 
 
 
319 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  35.56 
 
 
447 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  34.84 
 
 
447 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
447 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  34.3 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  32.21 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  33.91 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  27.85 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  27.85 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  27.85 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  27.85 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  29.47 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  27.78 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  31.4 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  33.15 
 
 
313 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 
441 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  28.63 
 
 
324 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  30.13 
 
 
319 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  28.33 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  27.36 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  28.74 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  27.64 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  31.4 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_004310  BR1813  heat shock protein HtpX  27.56 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  27.64 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  29.44 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  29.65 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  27.56 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  29.44 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  27.57 
 
 
279 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  30.77 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0423  peptidase M48 Ste24p  38.1 
 
 
298 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.666925  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0247  heat shock protein HtpX  38.1 
 
 
298 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  27.19 
 
 
281 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  29.74 
 
 
293 aa  56.2  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0714  heat shock protein HtpX  27.12 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000323195  normal  0.0549384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  31.43 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  28.14 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1114  heat shock protein HtpX  40 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.673422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5388  peptidase M48 Ste24p  29.28 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612832  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  26.24 
 
 
267 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0757  heat shock protein HtpX  37.65 
 
 
299 aa  53.9  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.736214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0675  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1785  peptidase M48 Ste24p  24.26 
 
 
295 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364036  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  26.97 
 
 
291 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  28.39 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  28.89 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0326  peptidase M48 Ste24p  28.06 
 
 
282 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  27.73 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  32.14 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  28.89 
 
 
315 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  29.05 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0236  heat shock protein HtpX  25.88 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  31.68 
 
 
397 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  28.96 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  31.68 
 
 
396 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  25.93 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  25.84 
 
 
292 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  30.26 
 
 
314 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  27.44 
 
 
286 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 
282 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1383  heat shock protein HtpX  36.76 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>