56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  100 
 
 
348 aa  702    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  61.14 
 
 
344 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  46.75 
 
 
351 aa  319  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  50.47 
 
 
346 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  48.33 
 
 
344 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  47.08 
 
 
352 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  46.04 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  47.02 
 
 
348 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  46.04 
 
 
336 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  46.04 
 
 
341 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  48.45 
 
 
364 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  50.16 
 
 
383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 
358 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  42.81 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  31.54 
 
 
320 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 
320 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 
320 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  34.46 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  34.46 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  33.57 
 
 
291 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  31.34 
 
 
320 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  33.09 
 
 
324 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0168  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 
329 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0842957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  32.21 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2224  peptidase M48 Ste24p  35.34 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  0.0711266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  31.29 
 
 
291 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  31.39 
 
 
318 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  28.68 
 
 
432 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  27.11 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  25.46 
 
 
447 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 
447 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  25.46 
 
 
440 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 
447 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  26.05 
 
 
444 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  25.23 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  30.88 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  26.17 
 
 
444 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 
447 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  25.23 
 
 
444 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 
447 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  28.02 
 
 
441 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  26.7 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  34.29 
 
 
265 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  27.01 
 
 
287 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  29.7 
 
 
267 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 
289 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1114  heat shock protein HtpX  31.88 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.673422  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  35.42 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  31.46 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1110  peptidase M48 Ste24p  39.47 
 
 
358 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21370  Heat shock protein  34.62 
 
 
278 aa  42.7  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>