44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2040 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 287 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  66.8 
 
 		 441 aa  335  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  53.56 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  52.74 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  58.74 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  47.06 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  32.16 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  36.08 
 
 		 447 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  35.57 
 
 		 447 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  34.07 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  35.57 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  26.77 
 
 		 447 aa  98.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 		 444 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 444 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 444 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 		 444 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 		 447 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  27.71 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  31.4 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  29.59 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  26.7 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  28.64 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  34.07 
 
 		 358 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  26.09 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  26.09 
 
 		 364 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  28.24 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  26.69 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  27.94 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  28.37 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  28.34 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  24.48 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  24.45 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  25.17 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  25.17 
 
 		 397 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  34.07 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  24.24 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>