More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1012 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  98.81 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  70.47 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  70.47 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  70.47 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  70.47 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  70.47 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  70.08 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  70.08 
 
 		 262 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  70.47 
 
 		 254 aa  358  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  71 
 
 		 235 aa  353  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  60.32 
 
 		 250 aa  325  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  63.1 
 
 		 250 aa  323  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  58.73 
 
 		 250 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  58.33 
 
 		 250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  57.94 
 
 		 250 aa  318  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  59.36 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  59.36 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  56.97 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  56.97 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  56.97 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  56.97 
 
 		 252 aa  308  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  56.97 
 
 		 252 aa  307  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  56.57 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  56.57 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  56.57 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  56.57 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  62.7 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  56.15 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  63.56 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  62.71 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  59.57 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  58.17 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  56.77 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  57.08 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  55 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  55 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  53.36 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  52.96 
 
 		 604 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  55.83 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  55.83 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  56.67 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  53.04 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  57.58 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  52.61 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  46.15 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  40.23 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  38.72 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  43.19 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  40.53 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  42.86 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.27 
 
 		 424 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  26.34 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  25.69 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  28.57 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  29.06 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  24.21 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  27.31 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.46 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  32.4 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  25.29 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.46 
 
 		 436 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  25.19 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  27.88 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  26.54 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  25.27 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  26.94 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  26.64 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  26.61 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  26.82 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  24.44 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  29.83 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  25.25 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  24.41 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  28.78 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  24.55 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  25.75 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  30.22 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.04 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  29.23 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.22 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  26.42 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>