62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2436 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  70.08 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  53.5 
 
 		 287 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  51.35 
 
 		 441 aa  242  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  43.53 
 
 		 441 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  46.64 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  35.07 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  39.59 
 
 		 447 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  39.59 
 
 		 447 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  39.09 
 
 		 447 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 		 444 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 		 444 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 		 444 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  28.9 
 
 		 447 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  28.9 
 
 		 447 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  28.83 
 
 		 447 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 		 447 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  28.29 
 
 		 440 aa  96.3  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  29.08 
 
 		 405 aa  89  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  29.47 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  34.19 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  30.41 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  29.33 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  27.8 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  24.52 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  24.52 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  23.5 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  30.21 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  26.79 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  28.44 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6074  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  34.51 
 
 		 348 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  22.91 
 
 		 324 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  27 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  28.83 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  28.27 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  27.27 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  26.36 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  26.58 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 364 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  25.86 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  26.58 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.42 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 344 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  25.74 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  36.97 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0795  peptidase M48 Ste24p  24.51 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1282  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  31.07 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  23.77 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  26.97 
 
 		 320 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  26.97 
 
 		 320 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 		 318 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  25.27 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  29.73 
 
 		 397 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1861  peptidase M48, Ste24p  40.54 
 
 		 348 aa  42  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0852  heat shock protein HtpX  26.36 
 
 		 287 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.356452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  37.04 
 
 		 289 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2745  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 		 269 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0732681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>