52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0289 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0289  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2436  hypothetical protein  70.08 
 
 		 265 aa  350  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0385312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1400  peptidase M48 Ste24p  51.36 
 
 		 441 aa  252  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2040  peptidase M48 Ste24p  52.74 
 
 		 287 aa  248  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02570  Zn-dependent protease with chaperone function  46.26 
 
 		 441 aa  231  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4397  peptidase M48 Ste24p  47.62 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2481  hypothetical protein  35.11 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.250784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2928  peptidase M48, Ste24p  35.43 
 
 		 447 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3013  peptidase M48 Ste24p  40.4 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3120  peptidase M48 Ste24p  39.09 
 
 		 447 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0114  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 		 444 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0109  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 		 444 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0113  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 		 444 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4244  peptidase M48 Ste24p  30.13 
 
 		 444 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0106  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 		 447 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0111  peptidase M48, Ste24p  28.44 
 
 		 447 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0111  peptidase M48, Ste24p  28.64 
 
 		 447 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0110  protease  27.67 
 
 		 447 aa  85.9  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0107  peptidase M48, Ste24p  29.13 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1164  peptidase M48 Ste24p  28.84 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2172  hypothetical protein  31.55 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  41.76 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1421  peptidase M48, Ste24p  43.01 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  29.47 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4955  peptidase M48 Ste24p  35.42 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7262  peptidase M48 Ste24p  36.26 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2707  hypothetical protein  30.52 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467935  normal  0.741997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5870  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1658  peptidase M48 Ste24p  36.26 
 
 		 352 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1335  peptidase M48, Ste24p  27.67 
 
 		 397 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000442106  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  27.24 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_002936  DET1587  M28 family peptidase  27.67 
 
 		 397 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0142134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7262  Zn-dependent protease with chaperone function- like protein  26.61 
 
 		 341 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000113025  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1471  peptidase, M28 family  30 
 
 		 396 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000107882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  28.75 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33120  Zn-dependent protease with chaperone function  32.97 
 
 		 348 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129861  normal  0.563955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12008  hypothetical protein  28.17 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00007831  normal  0.741274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1110  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 358 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  39.51 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5090  peptidase M48 Ste24p  34.82 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847465  normal  0.617728 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0075  heat shock protein HtpX  28.33 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4396  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1643  peptidase M48, Ste24p  39.77 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.691275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  31.71 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  38.27 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4018  heat shock protein HtpX  33.33 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000275488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1708  peptidase M48 Ste24p  35.07 
 
 		 631 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  35.14 
 
 		 312 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 		 228 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 432 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  29.47 
 
 		 292 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>