More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1855 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  100 
 
 
312 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  41.25 
 
 
250 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  45.16 
 
 
251 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  41.25 
 
 
250 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  41.25 
 
 
250 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  44.94 
 
 
250 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  40.89 
 
 
250 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  42.19 
 
 
252 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  42.19 
 
 
252 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  41.35 
 
 
252 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  41.35 
 
 
252 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  41.35 
 
 
252 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  41.35 
 
 
252 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  41.35 
 
 
252 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  41.35 
 
 
252 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  41.35 
 
 
252 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  41.35 
 
 
252 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  48.84 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  38.8 
 
 
254 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  43.04 
 
 
252 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  38.8 
 
 
254 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  38.8 
 
 
254 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  38.8 
 
 
254 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  38.8 
 
 
254 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  38.93 
 
 
262 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  38.4 
 
 
254 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  38.93 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  38.93 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  38.93 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  38.93 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  40.93 
 
 
252 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  38.93 
 
 
253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  38.63 
 
 
254 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  42.29 
 
 
253 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  42.36 
 
 
252 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  37.6 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  38.39 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  42.73 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  44.13 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  42.36 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  42.73 
 
 
253 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  41.07 
 
 
249 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  41.85 
 
 
253 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  39.06 
 
 
250 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  41.85 
 
 
253 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  40.93 
 
 
251 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  42.15 
 
 
604 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  43.18 
 
 
253 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  39.74 
 
 
250 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  41.27 
 
 
254 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  38.17 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  34.31 
 
 
269 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  39.23 
 
 
290 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 
274 aa  85.9  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.85 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.46 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  30.36 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  27.73 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  31.3 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  28.63 
 
 
285 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  27.31 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.19 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  28.85 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  27.67 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  32.92 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  26.46 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  26.46 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  25.5 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  28.7 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  25.1 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  29.32 
 
 
269 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  26.19 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  34.9 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  27.35 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  33.12 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  26.67 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  26.09 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  30.13 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  34.53 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  30.93 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  29.94 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  27.85 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  28.34 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.94 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  24.4 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>