More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0890 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 228 aa  460  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2687  peptidase M48, Ste24p  62.83 
 
 		 232 aa  301  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  71.29 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1185  peptidase M48, Ste24p  60.79 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126393  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2649  putative Zn-dependent protease  60.53 
 
 		 228 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157554  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1306  peptidase M48, Ste24p  60.53 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.278651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3987  peptidase M48, Ste24p  57.78 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  34.57 
 
 		 632 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  35.37 
 
 		 632 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.61 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  29.5 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  31.87 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  31.87 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 550 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  36.31 
 
 		 567 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  34.19 
 
 		 640 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  36.31 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  31.21 
 
 		 604 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  32.6 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  31.52 
 
 		 524 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  36.78 
 
 		 292 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  36.53 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  31.61 
 
 		 528 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  26.47 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  27.75 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.38 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  33.76 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  26.6 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 		 479 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  25.84 
 
 		 492 aa  68.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 		 500 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  28.07 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  28.16 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  31.82 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  31.82 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  31.61 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  31.82 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  31.82 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  31.82 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  31.82 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  32.52 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 		 478 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 564 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  35.23 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  30.1 
 
 		 470 aa  66.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 		 605 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 564 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.15 
 
 		 589 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  25.71 
 
 		 489 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 		 500 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  35.23 
 
 		 588 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  35.23 
 
 		 588 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  25.89 
 
 		 453 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.14 
 
 		 560 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.14 
 
 		 589 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 489 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.14 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.14 
 
 		 589 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 		 588 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.14 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.14 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.14 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.25 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  31.63 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  27.62 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  26.96 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  29.56 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  27.01 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  34.15 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>