More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3315 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  99.6 
 
 
252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  90.87 
 
 
252 aa  477  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  90.87 
 
 
252 aa  477  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  90.48 
 
 
252 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  90.87 
 
 
252 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  90.48 
 
 
252 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  90.48 
 
 
252 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  90.48 
 
 
252 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  90.48 
 
 
252 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  86.51 
 
 
252 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  75.81 
 
 
250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  73.49 
 
 
250 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  73.9 
 
 
250 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  73.9 
 
 
250 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  71.08 
 
 
250 aa  360  9e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  71.89 
 
 
250 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  63.05 
 
 
251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  60.16 
 
 
253 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  59.36 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  59.36 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  59.36 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  59.36 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  59.13 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  59.13 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  59.13 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  59.13 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  59.13 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  59.13 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  58.73 
 
 
254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  65.94 
 
 
252 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  60 
 
 
254 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  59.91 
 
 
235 aa  288  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  60.16 
 
 
251 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  58.8 
 
 
252 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  58.8 
 
 
252 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  54.69 
 
 
250 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  59.39 
 
 
249 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  55.78 
 
 
253 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  55.38 
 
 
253 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  55.38 
 
 
253 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  55.38 
 
 
604 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 
253 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  53.78 
 
 
253 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 
253 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  58.87 
 
 
250 aa  251  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  53.39 
 
 
254 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  56.83 
 
 
261 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  47.22 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  41.45 
 
 
312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  44.84 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  40.95 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  38.36 
 
 
289 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  40.45 
 
 
269 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.63 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  29.6 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  28.33 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  28.98 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  33.12 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.7 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  29.72 
 
 
278 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  27.16 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  26.34 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  27.4 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  25.9 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
269 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  25.78 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.12 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  30.28 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.9 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  28.92 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  26.32 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  28.23 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  30 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  28.23 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  27.49 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  34.44 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  28.23 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  29.41 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  26.22 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  27.55 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  31.94 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  31.07 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  31.07 
 
 
564 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  28.35 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  31.07 
 
 
588 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>