More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0775 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  99.6 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  99.21 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  99.21 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  99.6 
 
 		 252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  99.21 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  98.81 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  90.48 
 
 		 252 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  90.08 
 
 		 252 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  87.7 
 
 		 252 aa  444  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  74.6 
 
 		 250 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  69.08 
 
 		 250 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  69.08 
 
 		 250 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  68.67 
 
 		 250 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  67.47 
 
 		 250 aa  349  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  68.27 
 
 		 250 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  62.25 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  57.37 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  56.57 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  56.57 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  56.57 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  56.57 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  56.75 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  56.75 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  56.75 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  56.75 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  56.75 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  56.45 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  56.35 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  57.87 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  60.96 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  61.57 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  57.71 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  56.65 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  54.69 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  56.65 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  58.08 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  54.58 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 		 604 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  52.59 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  53.39 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  52.19 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  56.28 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  51.39 
 
 		 254 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  53.3 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  45.63 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  41.03 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  43.95 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  37.85 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  39.66 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  35.71 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  30.04 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.12 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  29.18 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  27.42 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  28.52 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  27.06 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  32.02 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  30.74 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  31.45 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 		 424 aa  82  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 		 365 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  31.27 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  28.23 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  24.7 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  30.98 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  26.17 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.6 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.1 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  30.53 
 
 		 483 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  24.52 
 
 		 472 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 564 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.5 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  25.57 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  26.51 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 		 588 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  29.65 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  26.48 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 		 588 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 		 588 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  28.43 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  29.13 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  28.21 
 
 		 605 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  26.61 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>