More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2649 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2649  putative Zn-dependent protease  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157554  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1306  peptidase M48, Ste24p  98.25 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.278651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1185  peptidase M48, Ste24p  92.11 
 
 		 228 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.126393  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  60.79 
 
 		 228 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2687  peptidase M48, Ste24p  61.33 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  65.71 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3987  peptidase M48, Ste24p  62.22 
 
 		 228 aa  255  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.88 
 
 		 264 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  32.69 
 
 		 550 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  31.15 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  26.75 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  24.67 
 
 		 632 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  24.67 
 
 		 632 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  26.75 
 
 		 252 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 		 268 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  26.75 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  26.75 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  26.75 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  26.75 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  26.75 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  26.75 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 		 640 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.46 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  33.9 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  33.9 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.06 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 		 359 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  27.19 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 		 605 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 		 588 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  33.89 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  34.76 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  31.76 
 
 		 490 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  31.61 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  28.49 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.22 
 
 		 589 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 		 487 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.1 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.72 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  26.03 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  32.6 
 
 		 478 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  34.19 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  32.37 
 
 		 590 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.53 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  29.59 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  27.93 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.33 
 
 		 492 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  27.18 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  29.57 
 
 		 504 aa  65.1  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  34.12 
 
 		 593 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  28.42 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  24 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  25.28 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  25.28 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  31.11 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  26.8 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  27.44 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  32.11 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  31.46 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  25.28 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  25.28 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  29.34 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  23.6 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  29.01 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  23.6 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  31.11 
 
 		 572 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  27.98 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  29.29 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  31.11 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  30.82 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  26.47 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>