More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2182 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
349 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  49.42 
 
 
357 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  49.56 
 
 
347 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  48.41 
 
 
348 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  46.96 
 
 
343 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  39.58 
 
 
336 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 
354 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 
341 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  33.84 
 
 
345 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  35.02 
 
 
363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  34.76 
 
 
345 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 
364 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  35.45 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  32.85 
 
 
347 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  33.87 
 
 
361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.24 
 
 
352 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  30.79 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  34.54 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  32.67 
 
 
353 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 
335 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  29.76 
 
 
348 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  29.76 
 
 
348 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  29.76 
 
 
348 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  34.2 
 
 
383 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  32.52 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.38 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 
374 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  32.74 
 
 
395 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  31.78 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  31.67 
 
 
383 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  38.53 
 
 
444 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.45 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  28.61 
 
 
327 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  28.99 
 
 
331 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  27.73 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  31.92 
 
 
378 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
378 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
378 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 
343 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 
483 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  25.57 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.82 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.15 
 
 
278 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  31.93 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  28.45 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.37 
 
 
573 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
605 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.81 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.97 
 
 
480 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  26.13 
 
 
358 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  31.01 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.91 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 
494 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 
569 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.64 
 
 
500 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  28.38 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  29.29 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.49 
 
 
513 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  24.24 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  30.16 
 
 
565 aa  72.8  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  29.59 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  28.1 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  30.04 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  24.37 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  32.7 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  32.7 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  27.95 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  28.38 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  32.7 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.7 
 
 
589 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  32.7 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  27.23 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  32.28 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  32.7 
 
 
589 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  34.13 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  32.7 
 
 
560 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  32.35 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  32.7 
 
 
589 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.87 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 
554 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  30.2 
 
 
513 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  29.78 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  28.14 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  32.5 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  25.83 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 
569 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 
484 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  28.74 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  33.75 
 
 
497 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  33.74 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>