More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0258 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 352 aa  672    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  37.46 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  34.77 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  36.61 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  36.25 
 
 		 347 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  35.33 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  38.68 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  36.82 
 
 		 361 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  36.42 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  33.44 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  35.24 
 
 		 349 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  34.49 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  33.23 
 
 		 357 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  33.14 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  34.2 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  31.73 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  26.49 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  41.67 
 
 		 398 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  35.78 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  26.25 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  41.97 
 
 		 444 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  41.97 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  25.61 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  27.5 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  40.93 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  27.5 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  26.9 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.16 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  34.19 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  34.33 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  35.19 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  33.78 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  37.07 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  38.4 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  36.24 
 
 		 292 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  34.9 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  34.19 
 
 		 479 aa  86.3  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  35.03 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.79 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  36.14 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  32.91 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  40.67 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  32.31 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  37.34 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  30.31 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.14 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  35.44 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  36.24 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  36.18 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  36.6 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  35.17 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  32.93 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.61 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  33.99 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  34.19 
 
 		 504 aa  69.3  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  31.92 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  34.67 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  37.58 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  34.67 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 		 280 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  31.08 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  30.54 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  36.3 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  36.17 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  35.58 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  34.23 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  34.97 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  29.34 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.17 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  35.57 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  33.12 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  32.89 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  31.33 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  31.29 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  31.29 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.26 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  35.06 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  35.81 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  35.81 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 503 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>