More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4143 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 347 aa  702    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  55.07 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  56.97 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  49.56 
 
 		 349 aa  328  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  46.94 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  39.65 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  36.54 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  38.08 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  37.5 
 
 		 364 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  39.37 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  36.75 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  34.26 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  34.59 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  32.21 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.55 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.36 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  31.89 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  34.75 
 
 		 444 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  34.81 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  26.63 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  30.39 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  29.28 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  32.6 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  31.96 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  29.4 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  29.13 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  31.42 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 		 378 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.03 
 
 		 264 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  31.51 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  27.61 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  28.36 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  34.15 
 
 		 479 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  31.38 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  37.91 
 
 		 280 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  34.41 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 		 478 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  35.52 
 
 		 513 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  34.81 
 
 		 268 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  26.06 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  26.46 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  38 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  34.05 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.73 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.24 
 
 		 479 aa  82.8  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  32.4 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  30.72 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.82 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  28.41 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  35.95 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  30.89 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  33.13 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  37.75 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  32.98 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  27.78 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 		 604 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  25.41 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  37.97 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  37.97 
 
 		 524 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  35.76 
 
 		 505 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  28.67 
 
 		 269 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  25.45 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  25.45 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  31.45 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  24.35 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  36.42 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  33.13 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  27.13 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  31.21 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  28.02 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 		 496 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 		 432 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  30.06 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  26.38 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  34.76 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0608  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  26.05 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  26.91 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>