More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0567 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 333 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  31.89 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.87 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.87 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  30.86 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  30.86 
 
 		 361 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  28.21 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  31.89 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  27.46 
 
 		 348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  30.9 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  29.29 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  32.86 
 
 		 444 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  27.3 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.02 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  29.18 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  25.87 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  26.89 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 		 398 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  28.19 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  26.11 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  33.11 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.85 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  26.25 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.49 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  26.38 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.44 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  30.29 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  29.37 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.12 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  27.57 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.73 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.93 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  26.98 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 		 632 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  30.57 
 
 		 632 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  29.14 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  31.71 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  34.53 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.48 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  32.19 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  29.73 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  28.51 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  29.73 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  29.73 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  29.73 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  29.73 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  29.73 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  29.73 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  32.65 
 
 		 640 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  33.56 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  33.56 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  33.56 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  29.68 
 
 		 528 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  33.56 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  32.88 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  28.92 
 
 		 502 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  32.52 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  33.56 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  28.07 
 
 		 605 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  30.46 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  30.46 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  31.1 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  25.93 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  27.04 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  30.46 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>