More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1120 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
354 aa  706    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  41.55 
 
 
363 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  39.66 
 
 
357 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  40.23 
 
 
348 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  36.54 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  40.57 
 
 
349 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  38.57 
 
 
343 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  33.51 
 
 
367 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  41.26 
 
 
336 aa  193  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  37.22 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  34.31 
 
 
364 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  32.66 
 
 
341 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  35.69 
 
 
353 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  36.51 
 
 
361 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  34.72 
 
 
358 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.33 
 
 
352 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 
349 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 
345 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 
333 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  30.23 
 
 
345 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 
383 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  32.57 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  30.14 
 
 
331 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.57 
 
 
335 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  32.87 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  32.29 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  38.82 
 
 
444 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  35.44 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  35.92 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.17 
 
 
348 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.17 
 
 
348 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.17 
 
 
348 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  31.97 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  27.89 
 
 
378 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  31.29 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  29.64 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.06 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  26.57 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  31.29 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  34.16 
 
 
573 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.87 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  37.2 
 
 
280 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.93 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.95 
 
 
490 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  32.92 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  32.1 
 
 
503 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  34.64 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
496 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.1 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.5 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  30.64 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.86 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  27.83 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  32.92 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.55 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.11 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 
605 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 
640 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  30.12 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.87 
 
 
565 aa  69.3  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
489 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 
289 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  30.86 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  32.28 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  25.93 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  32.1 
 
 
524 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  25.93 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  34.16 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  30.25 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  30.24 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  32.73 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.14 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  29.49 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.36 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 
562 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.05 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 
493 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  29.81 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 
541 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 
478 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>