More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3004 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  97.32 
 
 		 377 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 374 aa  735    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  55.45 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  53.54 
 
 		 398 aa  342  5e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  36.83 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  38.07 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  36.28 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  36.27 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  37.22 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  34.5 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  36.58 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.41 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  30.82 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  34.69 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  41.15 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  32.95 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  30.96 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  32.36 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.36 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.92 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  31.84 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.92 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  32.42 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  35.12 
 
 		 383 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  34.05 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.92 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  32.54 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  25.22 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  32.11 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.94 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  41.74 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  36.57 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.55 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  32.67 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  35.87 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  32.67 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  28.47 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  32.75 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.94 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  31.5 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  37.09 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  30.7 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  30.92 
 
 		 593 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  35.59 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  34.4 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  33.75 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  20.69 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30.05 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  20.69 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  29.56 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  28.27 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  32.68 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  32.96 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  32.95 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  34.52 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  38.94 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  29.07 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.07 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  36.14 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  29.95 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  33.12 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  29.07 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  31.95 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  36.57 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  29.95 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  37.17 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.74 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  28.74 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>