More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2155 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
327 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  36.58 
 
 
341 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 
361 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  36.08 
 
 
358 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  38.34 
 
 
364 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  35.84 
 
 
347 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 
347 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  34.02 
 
 
348 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  33.44 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  33.43 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
354 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  37.24 
 
 
383 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  36.39 
 
 
383 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  36.66 
 
 
395 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 
367 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 
353 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  28.61 
 
 
349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  30.93 
 
 
377 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  28.19 
 
 
335 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.19 
 
 
333 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.13 
 
 
331 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  32.01 
 
 
349 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  36.2 
 
 
444 aa  102  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 
398 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 
378 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  25.76 
 
 
363 aa  99  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  27.54 
 
 
345 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  26.38 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  27.76 
 
 
348 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  27.76 
 
 
348 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  27.76 
 
 
348 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  28.16 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  28.72 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  37.67 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  29.65 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  28.53 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.69 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.8 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  28.66 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  37.41 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  29.96 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  28.53 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 
604 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  30.48 
 
 
550 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  35.25 
 
 
632 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  35.25 
 
 
632 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  32.47 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  27.31 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.11 
 
 
513 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
528 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  24.36 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.91 
 
 
504 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.7 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  33.1 
 
 
640 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.28 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.28 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.48 
 
 
479 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
483 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  29.48 
 
 
479 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  31.55 
 
 
480 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.46 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  29.01 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  28.43 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  29.61 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  29.05 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  33.56 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  29.59 
 
 
447 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 
482 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
480 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  28.4 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  29.22 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 
505 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 
514 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  27.14 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  26.99 
 
 
492 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 
513 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.84 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 
424 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 
476 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  35.1 
 
 
481 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.95 
 
 
265 aa  63.2  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  34.62 
 
 
479 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  28.37 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  28.37 
 
 
235 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  27.94 
 
 
249 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  28.37 
 
 
254 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>