More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0429 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  93.91 
 
 		 345 aa  673    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 345 aa  710    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  59.01 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  59.01 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  59.01 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  32.43 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.62 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  33.84 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  30.59 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  30.16 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  29.36 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  30.09 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  31.19 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  27.02 
 
 		 367 aa  125  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  29.48 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  29.56 
 
 		 358 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.34 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  31.14 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  27.38 
 
 		 335 aa  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  29.9 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  30.18 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  31.69 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  29.29 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  25.84 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  31.7 
 
 		 444 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  27.52 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  30.35 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  30.68 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  25.96 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  28.25 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  28.94 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  27.39 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  31.41 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  28.91 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  32.48 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  23.4 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  28.71 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  32.39 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  26.85 
 
 		 640 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  27.31 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  27.27 
 
 		 528 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  26.99 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.22 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  31.17 
 
 		 573 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.62 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.99 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  31.1 
 
 		 589 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  31.1 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  31.1 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  31.1 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  31.1 
 
 		 589 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  31.1 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  31.1 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  25.17 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  31.1 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  28.4 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  32.48 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.08 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  27.22 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  28.39 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  30 
 
 		 590 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  22.08 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  22.08 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 569 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  26.55 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 564 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  27.67 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  28.75 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 		 553 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  30.19 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  30.19 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33244  predicted protein  27.1 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>