More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6656 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  100 
 
 		 383 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  57.02 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  38.64 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  37.61 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  37.77 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  35.8 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  27.96 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  28.82 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  28.14 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  29.59 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  27.74 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.43 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  27.61 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  30.49 
 
 		 358 aa  93.2  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  32.59 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  27.53 
 
 		 479 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  39.68 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  40.32 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  25.93 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.18 
 
 		 278 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  28.01 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  26.76 
 
 		 349 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 		 353 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  27 
 
 		 357 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  27.3 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  28.71 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  28.71 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  25.28 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.18 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 		 504 aa  82.8  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  31.65 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.45 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.45 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  30.9 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  28.49 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  32.17 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  22.46 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  27.74 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.81 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  26.36 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  31.89 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  32.37 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  30.54 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.61 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  26.41 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  26.41 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  26.41 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  31.94 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  30.05 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  30.05 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.21 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  27.83 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  28.23 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  33.13 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  23.96 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  29.17 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  26.54 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  30.85 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  27.43 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  29.5 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  28.9 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  27.82 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  30.43 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  27.48 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  37.41 
 
 		 550 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  31.51 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  30.43 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.65 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31.36 
 
 		 483 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 		 472 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  29.37 
 
 		 333 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  34.68 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>