More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1147 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
363 aa  737    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  41.55 
 
 
354 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  35.61 
 
 
357 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  36.15 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  35.99 
 
 
343 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  36.08 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  32.31 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  34.26 
 
 
347 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 
364 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 
361 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  32.95 
 
 
347 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  32.76 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.2 
 
 
352 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
349 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  34.71 
 
 
349 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  32.11 
 
 
341 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 
345 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 
345 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  30.51 
 
 
335 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 
333 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  28.15 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 
383 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  29.25 
 
 
348 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  29.25 
 
 
348 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 
348 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  33.63 
 
 
383 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  34.87 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  33.24 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  34.56 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  39.19 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  32.03 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  27.65 
 
 
327 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  28.52 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  33.12 
 
 
483 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.7 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  35.62 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  31.65 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  37.27 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  30.97 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  29.2 
 
 
493 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  31.48 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  34.42 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  34.42 
 
 
502 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.71 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  37.82 
 
 
280 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  33.53 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 
541 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  36.73 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.82 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  32.31 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  33.33 
 
 
436 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  30.07 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  32.69 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  34 
 
 
632 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  34 
 
 
632 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.8 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 
605 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  30.38 
 
 
427 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 
493 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 
569 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.37 
 
 
423 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 
514 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  35.95 
 
 
524 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 
479 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  36.3 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  29.95 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  29.84 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  29.84 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  28.12 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  30.92 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  30.77 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  33.55 
 
 
504 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  30.72 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  30.72 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  28.48 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
521 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>