More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1976 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 373 aa  732    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  86.77 
 
 		 378 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  86.51 
 
 		 378 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  59.22 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  39.89 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  36.36 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  32.13 
 
 		 364 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  34.92 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  34.3 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  30.51 
 
 		 341 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  31.38 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  30.64 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.5 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  29.68 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.44 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  29.86 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.62 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  29.64 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.71 
 
 		 278 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  28.25 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  30.54 
 
 		 336 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  26.35 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  28.81 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  35.09 
 
 		 352 aa  93.6  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  31.92 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.39 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  29.28 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.89 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  27.22 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 		 504 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.46 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  29.08 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  31.93 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  31.93 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  21.89 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  30.7 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  32.96 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  36.69 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  27.31 
 
 		 492 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.17 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  34.88 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  34.68 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  38.79 
 
 		 533 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  34.66 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  32.63 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.17 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  28.34 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  28.66 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.32 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.29 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.16 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  24.36 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  33.51 
 
 		 548 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  24.36 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  29.07 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  31.46 
 
 		 493 aa  72.8  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  29.57 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  29.39 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  23.51 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  28.02 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  25.52 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  30.49 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.52 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  29.52 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  22.78 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  26.99 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  29.88 
 
 		 605 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  27.55 
 
 		 604 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  32.5 
 
 		 521 aa  67  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  32.5 
 
 		 521 aa  67  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.56 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 		 293 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  28.1 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 		 564 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  26.43 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  29.36 
 
 		 589 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  29.36 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  30.25 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  30.11 
 
 		 251 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30.27 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 588 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 588 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  31.06 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  31.15 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  29.36 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>